課程資訊
課程名稱
專題研究
SPECIAL TOPICS FOR UNDERGRADUATE 
開課學期
97-2 
授課對象
生物機電工程學系  
授課教師
陳倩瑜 
課號
BME4201 
課程識別碼
611 49100 
班次
19 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
 
上課地點
 
備註
總人數上限:10人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/972specialTopics 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本學期將針對microarray data analysis一特定主題做討論 

課程目標
使同學熟悉從事microarray data analysis相關研究必需具備之知識與技能 
課程要求
參與討論 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
每週四 17:30~19:00 備註: 地點: 知武館R402 
指定閱讀
 
參考書目
Guide to Analysis of DNA Microarray Data
(http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/bookhome/109802392?
CRETRY=1&SRETRY=0)
Microarray Technology and Cancer Gene Profiling
(http://www.springerlink.com/content/k44786/)
You need ntu IPs to access the e-books. 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
報告 
30% 
 
2. 
討論 
70% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
02/19  定訂本學期目標 
第2週
02/26  尋找相關文獻+文獻剖析+分工+EndNote教學 
第3週
03/05  針對國科會大專生專題計畫書之撰寫進行討論
(請於討論前將檔案上傳) [Tutors: Aimi and me] 
第4週
03/12  microarray data introduction [皓涵+雲捷] 請從 Central dogma of molecular biology 開始講, 然後帶入microarry之原理 與 cDNA和oligonucleotide arrays 之差異!
[Tutor:艾彌] 
第5週
03/19  The use and analysis of microarray data [雲捷] gene selection [雲捷][Tutor:建智] 
第6週
03/26  肝癌123 [皓涵][Tutor:玫如] 
第7週
04/02  溫書假 
第8週
04/09  ChIP-seq [大二同學][Tutor:艾彌] 
第9週
04/16  期中考週休息 
第10週
04/23  期中考週繼續休息 
第11週
04/30  R Tutorail I 
第12週
05/07  R Tutorail II 
第13週
05/14  R Tutorail III 
第14週
05/21  data clustering (hierarchical clustering) 
第15週
05/28  端午節 
第16週
06/04  data classification (Fisher linear classifier) (SVM) 
第17週
06/11  presentation of 雲捷's paper and data clustering using R 
第18週
 
presentation of 皓涵's paper and data classification using R